一、人们称九寨沟那些湖泊为“五花海”“五彩池”主要来源于传说

传说一

传说女娲补天的时候需要许多五彩石，她为了找这些五彩石忙了几天几夜，才找到了红、黄、蓝、白、青五种颜色的石头。她对它们进行了冶炼，炼了十天十夜五彩石终于化成了很稠的液体。女娲把他们装在一个大盆子里，端到天边，对准那个大黑窟窿，使劲一泼，只见金光四射，大窟窿立刻就补好了。而她泼的时候掉出的液体落到了地上，形成的每一个小坑就是一滴五彩斑斓的湖水。又经过雨水的冲洗，它越来越稀，就变成了现在的黄龙五彩池，而其中一大块黄色液体沿着山坡滚了下来铺满了整个山坡就形成了一片金黄，瀑布流下来金光闪闪，这就是著名的金沙铺地

传说二

九寨沟景观的奇特之处首先在于它有108个清澈的海子（当地人习惯称湖泊为“海子”）。传说在十分遥远的年代，神女沃诺色姆的情人剽悍的男神达戈送给她一面宝镜，沃诺或许是太高兴了，竟不慎失手把宝镜摔成了108块，而这108块碎片便成了108个被称为“翠海”的彩色湖泊。

传说三

天上王母娘娘的宫苑内有五彩瑶池，有山风吹过，那更是满湖五彩缤纷，真的恍如五彩瑶池落入人间。在当地曾盛传，这是仙女的胭脂水染成

二、科学的解释如是说

寨沟内大多数湖泊海子的真正形成，是与流水中含有的碳酸钙质有关。在那远古时代，当地球处于很冷很冷的间冰期、小冰期阶段，这里水中的碳酸钙质不能凝结，它们随水流逝。到距今大约一万二千多年前，地球气候变暖后，流水中的碳酸钙才活跃起来，它们一遇障碍物就附着其上，千年万年，越积越多，也越积越厚，便形成了如人们在九寨沟见到的，由一条条乳白色的钙质堤埂蓄水而成的“海子”，在地质学上称之为堰塞湖。

彩池池水颜色各异的起因，主要源于：
1、池水中常见的CA2+、MG2+，HCO3-等离子也有增强短波光散射的作用。
2、池水透明度高，湖底的灰白色钙华、黄绿色藻类对透射光的选择性吸收和反射。
3、池水对太阳光的散射、反射和吸收（太阳光或自然光是由不同波长的单色光组合而成的复色光，在光谱中，由红光至紫光，波长逐渐减小）。
4、部分周围的景物在水中的影子，或反射到了水里。